Baterija je najvažnija komponenta opreme za elektroničku cigaretu, koja opskrbljuje električnu energiju glavnoj opremi, zagrijava električne žice i čini da atomizer radi. Na tržištu postoje sve vrste baterija.
Elektronske cigarete koriste litijum-jonske baterije. Litijum-jonske baterije imaju visoku gustinu energije i srednji izlazni napon. Automatsko pražnjenje je malo, a baterija je dobra, ispod 2 posto mjesečno (može se reciklirati). Nema efekta memorije. Raspon radne temperature je veoma širok, od - 20 stepeni C do 60 stepeni C. Odlične performanse ciklusa, brzo punjenje i pražnjenje, efikasnost punjenja do 100 posto, velika izlazna snaga. Dug vijek trajanja. Ne sadrži otrovne i štetne tvari i zove se zelena baterija. Radni napon jedne baterije može doseći do 3,5,8 V (3,2 V litijum gvožđe fosfat), tri puta više od starijih nikl-vodikovih baterija. Osim toga, litijum-jonske baterije imaju dug životni vijek, općenito do 500 ili čak više od 1000 puta, dok litijum željezo fosfat može doseći više od 2000 puta, štedeći mnogo troškova korištenja. Litijum-jonska baterija takođe ima dobre bezbednosne performanse, nema zagađenja i nema efekta memorije. Ne sadrži elemente koji zagađuju okolinu, kao što su kadmij, olovo i živa. I nema "efekta pamćenja".